Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP2Q9UDT6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms