Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLKQ9UBT6 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms