Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms