Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCC13Q9NSE7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms