Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms