Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms