Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms