Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms