Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms