Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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CLIP4Q8N3C7 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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CLIP4Q8N3C7 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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CLIP4Q8N3C7 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CLIP4Q8N3C7 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CLIP4Q8N3C7 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CLIP4Q8N3C7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CLIP4Q8N3C7 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CLIP4Q8N3C7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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