Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms