Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms