Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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CCBE1Q6UXH8 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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CCBE1Q6UXH8 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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