Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms