Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms