Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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