Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FXNQ16595 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FXNQ16595 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FXNQ16595 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FXNQ16595 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FXNQ16595 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FXNQ16595 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FXNQ16595 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FXNQ16595 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FXNQ16595 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FXNQ16595 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FXNQ16595 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FXNQ16595 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FXNQ16595 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FXNQ16595 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FXNQ16595 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FXNQ16595 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FXNQ16595 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FXNQ16595 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
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