Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC022167.5-201ENST00000636296 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 MIR6749-201ENST00000617008 69 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 MRPL23-203ENST00000397294 551 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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