Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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CDSNQ15517 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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