Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SYCP1Q15431 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SYCP1Q15431 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SYCP1Q15431 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SYCP1Q15431 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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