Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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