Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms