Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms