Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABPAQ06546 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms