Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RBM5-AS1-201ENST00000630404 1386 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ALX1-201ENST00000316824 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL359641.1-201ENST00000412509 1558 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC131888.1-201ENST00000625028 2168 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC211485.1-201ENST00000417100 1107 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC092130.1-201ENST00000565531 531 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL121929.2-201ENST00000609691 1432 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms