Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms