Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PGGT1BP53609 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PGGT1BP53609 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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PGGT1BP53609 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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PGGT1BP53609 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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PGGT1BP53609 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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