Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VEGFBP49765 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 PDLIM1P1-201ENST00000604187 969 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms