Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTAP49354 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTAP49354 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTAP49354 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTAP49354 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTAP49354 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTAP49354 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTAP49354 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTAP49354 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTAP49354 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTAP49354 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTAP49354 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNTAP49354 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNTAP49354 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNTAP49354 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNTAP49354 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNTAP49354 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNTAP49354 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNTAP49354 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNTAP49354 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNTAP49354 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNTAP49354 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNTAP49354 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTAP49354 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNTAP49354 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms