Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NESP48681 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NESP48681 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NESP48681 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
NESP48681 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
NESP48681 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NESP48681 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NESP48681 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NESP48681 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NESP48681 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NESP48681 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NESP48681 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms