Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms