Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E1P29083 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms