Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLD1P28340 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms