Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms