Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CNTFRP26992 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms