Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPREP23469 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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