Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms