Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDCP19113 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDCP19113 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDCP19113 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDCP19113 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDCP19113 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDCP19113 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDCP19113 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDCP19113 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDCP19113 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDCP19113 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDCP19113 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDCP19113 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDCP19113 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDCP19113 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDCP19113 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDCP19113 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDCP19113 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms