Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GM2AP17900 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GM2AP17900 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GM2AP17900 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GM2AP17900 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GM2AP17900 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GM2AP17900 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GM2AP17900 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GM2AP17900 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GM2AP17900 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GM2AP17900 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GM2AP17900 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GM2AP17900 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms