Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

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Length 629 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SMPD1P17405 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SMPD1P17405 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPD1P17405 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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