Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms