Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms