Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFTRP13569 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFTRP13569 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFTRP13569 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFTRP13569 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CFTRP13569 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFTRP13569 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFTRP13569 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFTRP13569 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFTRP13569 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFTRP13569 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFTRP13569 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFTRP13569 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CFTRP13569 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFTRP13569 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFTRP13569 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.2 ms