Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTN1P12814 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms