Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG7O95352 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ATG7O95352 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG7O95352 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG7O95352 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms