Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN2BO60939 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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