Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms