Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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