Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms