Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms